ஆண்டிபயாடிக் சிகிச்சையின் தொடர்ச்சியான சிக்கலுக்கான சிகிச்சையாக மலம் மாற்று அறுவை சிகிச்சை செய்யப்படுகிறது, இது வயிற்றுப்போக்கு, வயிற்றுப் பிடிப்பு மற்றும் சில நேரங்களில் காய்ச்சலுடன் தொடர்புடையதாக இருக்கலாம்.
இது மீண்டும் மீண்டும் வரும் சி. டிஃபிசில் பெருங்குடல் அழற்சிக்கு சிகிச்சையளிப்பதற்காக ஆரோக்கியமான நன்கொடையாளரிடமிருந்து இரைப்பைக் குழாயில் மலத்தை மாற்றுவதாகும். மலம் மாற்று அறுவை சிகிச்சை பொதுவாக கொலோனோஸ்கோபி மூலம் செய்யப்படுகிறது மற்றும் குறைவாக பொதுவாக நாசோடூடெனல் குழாய் மூலம் செய்யப்படுகிறது. கொலோனோஸ்கோபியின் போது கொலோனோஸ்கோப் முழு பெருங்குடல் வழியாக முன்னேறும். கொலோனோஸ்கோப் திரும்பப் பெறப்பட்டவுடன், கொலோனோஸ்கோபி மூலம் நன்கொடையாளர் மலம் நோயாளியின் பெருங்குடலுக்குள் செலுத்தப்படுகிறது.